建有潔凈車間的食品工廠在選址、設(shè)計、布局、建設(shè)和改造時應(yīng)**大限度避免污染源、交叉污染、混料和差錯的發(fā)生。廠區(qū)環(huán)境整潔、人流和物流走向合理。應(yīng)有適當(dāng)門禁措施，防止未經(jīng)批準(zhǔn)人員的進(jìn)入。保存建設(shè)和施工的竣工資料生產(chǎn)過程中發(fā)生空氣污染較為嚴(yán)重的建筑，應(yīng)建設(shè)在廠區(qū)常年**多風(fēng)向的下風(fēng)側(cè)。相互有影響的生產(chǎn)工藝，不宜設(shè)在同一建筑物內(nèi)時，各自生產(chǎn)區(qū)域之間應(yīng)有有效的隔斷措施。生產(chǎn)發(fā)酵產(chǎn)品應(yīng)具備專用發(fā)酵車間。

模式一：標(biāo)準(zhǔn)組合室空調(diào)風(fēng)柜+空氣過濾系統(tǒng)+潔凈室通風(fēng)保溫管道+HEPA高效送風(fēng)口+潔凈室回風(fēng)管道系統(tǒng)的工作原理，不斷的循環(huán)和補(bǔ)充新風(fēng)送人潔凈室車間內(nèi)，以達(dá)到生產(chǎn)環(huán)境所需的潔凈度。

模式二：潔凈室車間口安裝FFU工業(yè)空氣凈化器直接往潔凈室送風(fēng)+回風(fēng)柱回風(fēng)系統(tǒng)+吸頂式空調(diào)機(jī)制冷的工作原理。這種形式一般對用于環(huán)境潔凈度要求不是非常高的場合，并且成本相對低一些。如食品生產(chǎn)車間、普通的理化實驗室工程、產(chǎn)品包裝間、化妝品生產(chǎn)車間等。

潔凈室選用不同的送風(fēng)及回風(fēng)系統(tǒng)的不同設(shè)計是決定潔凈室不同潔凈度等級決定性因素。